Поскольку Сестра и впадает, и вытекает из Сенежа, наполняя и снабжая его водой, озеро с полным правом можно считать одной из составных частей реки. Сенеж — водоем искусственный. Еще во времена Петра I был составлен проект соединения верхней части Волги с Москвой-рекой каналом, который должен был соединить реки Дубну (приток Волги) и Сестру с Истрой — притоком реки Москвы. Это сократило бы водный путь между Петербургом и Москвой более чем на 1000 верст. Но о проекте благополучно забыли, и лишь в конце первой четверти XIX века вновь вернулись, к этому вопросу. Канал начали строить в 1826 г. И закончили только в 1850 г. За двадцать пять лет построили 8,5 км водного пути между Сестрой и Истрой, 33 каменных шлюза (в том числе 20 на Сестре), подпорные плотины и подъемные мосты и плотины существенно изменили и ее левый приток. Вода большое озеро Сенеж (ледникового происхождения), площадь которого ранее была всего лишь 66 га. Первоначально же Сенеж находился на месте нынешнего залива Мазихи. Благодаря новому озеру в канале поддерживался достаточно высокий уровень воды. По нему в Москву пошли баржи, груженные камнем. Но с постройкой в 1851 г. Николаевской железной дороги канал забросили, так как перевозка грузов по нему обходилась дороже. Канал постепенно пришел в упадок, и в 1860 г. Водная система была закрыта. До наших дней сохранились лишь остатки прежних сооружений, а озеро Сенеж вскоре приобрело облик естественного водоема. Площадь «современного» Сенежа при нормальном подпорном уровне — около 850 га, и теперь это — крупнейшее озеро в Подмосковье. Форма его неправильная, лопастная, обусловленная образующими его заливами рек Сестры и Мазихи.
