Попытки польской власти взять под контроль казаков привело к активному протесту против существующего режима. Первая волна восстаний была короткой (1591-1596 гг), а вторая — длительной (1625-1638 гг.) Главной движущей силой народных выступлений стало казачество. Восстание Кшиштофа Косинского (1591-1593 гг.) Стало одним из первых крупных крестьянско-казацких выступлений. Казаки овладели всей Брацлавщиной, Киевщине и другими землями. Косинский титуловал себя гетманом и заставлял людей присягать казацкой власти вместоблагородной. Возле г. Пятки в начале 1593 состоялась решающая битва между казаками и поляками после которой завершается первый этап этой волне восстаний. В 1594 г. Начинаются восстания под предводительством С. Наливайко, М. Лободы, М. Шаулы и др. Характерной чертой этого этапа борьбы было сочетание социальной борьбы с защитой православной церкви. На сторону повстанцев перешла значительная часть священников, в том же числе и брат С. Наливайко православный священник Д. Наливайко. Однако эти народные выступления потерпели поражение. В течение следующих тридцати лет крупных восстаний не было. Польша не имела постоянного отношение к казачеству, поэтому репрессии часто менялись на «милость» — увеличение реестра, предоставление привилегии и т.д. лично Польша нуждалась в военной силе, ведь часто вела войну с Турречиною, Московским государством. И постоянно обращалась за помощью к казакам. Так, накануне битвы под Хотином, польское правительство согласилось с П. Сагайдачным на увеличение реестра до 3 тыс.человек и выплату им жалованья в сумме 40 тыс. Злотых в год.
